生物器官及组织具备天然的三维空间特性,德运康瑞DynaSpatial空间转录组技术基于高密度修饰芯片,可检测组织不同位置细胞中的基因表达信息,关键基因检出性能提升5倍,有效解析空间异质性、组织微环境以及结构特征。在发育研究、肿瘤微环境、神经及疾病研究领域带来突破性的发现和成果。

技术流程

(1)组织透化

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(2)捕获建库

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生信分析

德运康瑞DynamicST软件可将基因表达信息与组织切片的位置信息结合起来,直观地展示细胞类型在组织切片上的空间分布以及差异基因的空间分布。后续通过生信分析流程对这些差异基因进行功能富集,从而鉴定亚群的功能特征。德运康瑞同时提供第三方软件Seurat的基本分析结果,还可根据用户需求提供细胞定义、拷贝数分析、配受体分析等个性化分析内容。

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样本要求

(1)新鲜组织样本,进行OCT冷冻包埋;

(2)包埋组织块大小为 5*5 mm2, 每个样本4个备份;

(3)切片厚度10μm,组织切片RNA RIN>7.0。


应用方向

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