DynaSpatial探针法空间转录组产品-苏州德运康瑞生物科技有限公司

DynaSpatial探针法空间转录组产品

详细介绍：

DynaSpatial是德运康瑞基于高密度芯片开发的空间转录组产品，针对大量临床FFPE 样本推出双连接探针捕获的解决方案，DynaSpatial探针法产品实验流程通过DynaBlot空间组学转印仪完成，可以完成FFPE 样本从常规组织切片到捕获芯片的探针连接产物转片，同样兼容新鲜冰冻 (FF) 样本，无需进行组织透化预实验，大大简化了实验流程操作，双连接探针的设计和高密度捕获芯片的“双倍加持”,保证了DynaSpatial探针法产品基因检测的特异性和灵敏度。

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DynaSpatial探针法产品整体流程

DynaSpatial探针法实验方案需要借助DynaBlot设备完成，您可以在标准载玻片上制备组织切片，然后开展空间分析实验，就像典型的组织学流程一样，随后可以对切片进行脱蜡、染色(H&E)和成像。在准备好开始空间分析时，可对切片进行解交联并与转录组探针杂交，在探针杂交后， DynaBlot设备可帮助将这些转录组探针从载玻片转移到捕获玻片的捕获区域，然后继续完成探针延伸和文库构建等步骤。

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关于DynaBlot设备

DynaBlot是一款小巧的台式设备，能够将转录组探针从标准的载玻片转移到捕获玻片上，便于您从更多种类的样本(特别是临床FFPE样本)进行空间转录组的研究分析。DynaBlot仪器与H&E染色切片适配，让预先以切片形式保存的组织也能适用于空间转录组工作流程。您可以先进行常规的组织学操作，筛选到合适组织切片，找到有生物学意义的病理区域，然后用 DynaBlot设备将这些临床切片与捕获玻片的捕获区域精确对齐，完成样本的空间转录信息的捕获和定位。

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产品优势

小鼠嗅球实测数据展示

（1）小鼠嗅球实测数据

用小鼠嗅球样本进行demo测试，组织覆盖828个有效spots，在测序饱和度63.32%时，基因中位值达到6402，总基因数达到16677个，测序reads mapping到探针库的比例达到99.34%，并且spot根据基因表达无监督聚类分群为8个不同cluster，跟组织结构分区一一对应，并且空间转录组分析得到的差异表达基因所在组织位置，与Allen数据库中原位杂交结果吻合，这也证明DynaSpatial探针法捕获检测的基因表达量和表达位置的准确性。

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（2）小鼠嗅球UMI表达分布和分群聚类

小鼠脑组织实测数据展示

（1）小鼠脑组织实测数据

用小鼠脑样本进行demo测试，组织有效覆盖2645个spots，在测序饱和度71.41%时，基因中位值达到6386，基因表达数量分布符合组织区域特征，测序reads mapping到探针库的比例达到96.66%，根据基因表达无监督聚类，spot分群为19个不同cluster，并且聚类分群的空间投射结果与组织结构特征完美对应，cluster分群之间有明显的区分度，这也证明DynaSpatial可以很好的区分脑组织结构的空间异质性，并且可以和HE图像结合深入分析。

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